武功系统的核心难点在于残章获取与合成机制的复杂性。玩家需通过历练中的夺残章功能收集特定武功的全部残章才能合成完整武功，而初始仅能通过武功箱小概率获得甲级或乙级残章。每次搜索或抢夺残章消耗2点元气，且必须已拥有该武功的至少一个残章才能触发争夺流程。这一设计导致高阶武功的成型周期长，资源分配需高度精准，尤其对零氪玩家而言，元气管理与残章目标的选择直接影响战力提升效率。
武功培养的另一难点在于属性搭配与实战效果的平衡。红色武功作为顶级武学，其攻击力、破防、暴击等基础属性虽突出，但特殊效果如剑围反击等需依赖特定弟子触发。例如铁血中棠升金后的剑围效果需友方弟子受击才生效，这种条件限制使得武功与弟子阵容的契合度成为关键。玩家需深度理解每本武功的隐藏机制，避免盲目追求高属性而忽略实战适配性。
28种心法分为回血、真气、控制等类型，进阶条件苛刻且效果差异显著。如销魂心法需血战80关才能解锁全体回血功能，而罗汉伏魔心法虽易获取却有属性削减副作用。心法搭配需综合考虑弟子定位（如MT血牛优先回血类）、战斗阶段（后期触发型心法效用更高）以及真气槽管理，这种多维度的决策要求玩家具备较强的预判与调整能力。
社交互动对武功成长的隐性制约常被低估。高阶玩法如围剿奸细天机十二阁需组队完成，而金色武功残页等稀有资源多通过公会活动投放。独狼玩家在资源获取效率上天然劣势，且部分合璧技能需特定弟子组合激活，这迫使玩家在社交投入与个人养成节奏间寻找平衡。版本更新带来的新武功或升金机制（如橙色弟子锻骨易经升红）要求玩家持续关注动态，进一步增加时间成本。
武功系统的终极难点在于长期养成与版本迭代的博弈。玩家既要在当前版本优化武功组合，又需为未来可能出现的升金、新缘分等机制预留资源。例如存留特定橙色弟子魂魄以备升红，或克制对非核心武功的资源投入。这种兼顾即时战力与长远发展的双重压力，使得武功系统成为大掌门2中策略深度与操作门槛并存的代表性玩法。
